Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1D2Q14995 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1D2Q14995 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms