Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RUNX2Q13950 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUNX2Q13950 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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