Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX3Q13761 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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