Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFIAQ12857 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFIAQ12857 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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