Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	NMD4	YLR363C	657 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	OSW5	YMR148W	447 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	TOM40	YMR203W	1164 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	POP3	YNL282W	588 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	FMP30	YPL103C	1407 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	SET6	YPL165C	1122 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	ARO7	YPR060C	771 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	LPL1	YOR059C	1353 nt		4.25	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	SSH1	YBR283C	1473 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YFL064C	YFL064C	525 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	PEX22	YAL055W	543 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YLR374C	YLR374C	390 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MRPL24	YMR193W	777 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YOR292C	YOR292C	930 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YPL191C	YPL191C	1083 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	TIP41	YPR040W	1071 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	YPR202W	YPR202W	717 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	SWI3	YJL176C	2478 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	DIT1	YDR403W	1611 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	ARH1	YDR376W	1482 nt		4.24	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	EMP47	YFL048C	1338 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	APC1	YNL172W	5247 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	PMT4	YJR143C	2289 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	UBC6	YER100W	753 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	ARO2	YGL148W	1131 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	FMP48	YGR052W	1110 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	AAD10	YJR155W	867 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MRPL4	YLR439W	960 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	SAP30	YMR263W	606 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	PWR1	PWR1	941 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	REI1	YBR267W	1182 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	ALG6	YOR002W	1635 nt		4.23	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	GAL11	YOL051W	3246 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	ATP5	YDR298C	639 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	SOL4	YGR248W	768 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	CYC1	YJR048W	330 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	GTR1	YML121W	933 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	MET12	YPL023C	1974 nt		4.22	□□□□□ -1.73
VIK1	Q12045	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	THI13	YDL244W	1023 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	ARP10	YDR106W	855 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	SNM1	YDR478W	597 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	PRM10	YJL108C	1152 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	THI11	YJR156C	1023 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	SPC42	YKL042W	1092 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YDC1	YPL087W	954 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	PBN1	YCL052C	1251 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YDR132C	YDR132C	1488 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	PRP9	YDL030W	1593 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YBR138C	YBR138C	1575 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	DIP2	YLR129W	2832 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	TEL1	YBL088C	8364 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	ARF2	YDL137W	546 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	NUP42	YDR192C	1293 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	PCL6	YER059W	1263 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	COX4	YGL187C	468 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YPT53	YNL093W	663 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	GAD1	YMR250W	1758 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	TPA1	YER049W	1935 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	ADD66	YKL206C	804 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	CWC25	YNL245C	540 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	IDI1	YPL117C	867 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	ATG14	YBR128C	1035 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	UMP1	YBR173C	447 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	SRB6	YBR253W	366 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YMR221C	YMR221C	1515 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	RAD52	YML032C	1416 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	LAP2	YNL045W	2016 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	IML2	YJL082W	2196 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	BUD8	YLR353W	1812 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	BCK2	YER167W	2556 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	SMP1	YBR182C	1359 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	HMG1	YML075C	3165 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YDL094C	YDL094C	510 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	RRP45	YDR280W	918 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	IRC9	YJL142C	393 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	MHO1	YJR008W	1017 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	MRPL39	YML009C	213 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YPL014W	YPL014W	1146 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	ATG2	YNL242W	4779 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YER077C	YER077C	2067 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	LPP1	YDR503C	825 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	LSB1	YGR136W	726 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	VPS29	YHR012W	849 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	RCL1	YOL010W	1104 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	RSC3	YDR303C	2658 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	MAG2	YLR427W	2013 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YMR086C-A	YMR086C-A	339 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YOL079W	YOL079W	399 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	SPO19	YPL130W	672 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VIK1	Q12045	YPR150W	YPR150W	522 nt		4.16	□□□□□ -1.74

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