Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTDSPL2Q05D32 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CTDSPL2Q05D32 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDSPL2Q05D32 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms