Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP3Q02447 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP3Q02447 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP3Q02447 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP3Q02447 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP3Q02447 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP3Q02447 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP3Q02447 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP3Q02447 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP3Q02447 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP3Q02447 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP3Q02447 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SP3Q02447 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP3Q02447 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP3Q02447 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP3Q02447 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SP3Q02447 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP3Q02447 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP3Q02447 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP3Q02447 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP3Q02447 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP3Q02447 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP3Q02447 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP3Q02447 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP3Q02447 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP3Q02447 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP3Q02447 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP3Q02447 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP3Q02447 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SP3Q02447 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SP3Q02447 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SP3Q02447 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SP3Q02447 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP3Q02447 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms