Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCEQ02156 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCEQ02156 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCEQ02156 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms