Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP1P59025 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP1P59025 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP1P59025 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP1P59025 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP1P59025 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP1P59025 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP1P59025 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP1P59025 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP1P59025 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP1P59025 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP1P59025 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP1P59025 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP1P59025 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP1P59025 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP1P59025 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP1P59025 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP1P59025 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP1P59025 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP1P59025 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP1P59025 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP1P59025 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP1P59025 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP1P59025 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP1P59025 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP1P59025 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP1P59025 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP1P59025 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP1P59025 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP1P59025 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP1P59025 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP1P59025 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms