Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGAEP38570 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms