Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO2P25791 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO2P25791 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO2P25791 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMO2P25791 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO2P25791 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO2P25791 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO2P25791 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO2P25791 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO2P25791 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO2P25791 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO2P25791 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO2P25791 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO2P25791 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO2P25791 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO2P25791 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO2P25791 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO2P25791 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO2P25791 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms