Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME1P15531 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NME1P15531 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NME1P15531 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NME1P15531 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NME1P15531 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NME1P15531 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NME1P15531 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NME1P15531 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME1P15531 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME1P15531 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME1P15531 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms