Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL1A2P08123 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL1A2P08123 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms