Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOL3O95236 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOL3O95236 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOL3O95236 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOL3O95236 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOL3O95236 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOL3O95236 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOL3O95236 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms