Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GABARAPO95166 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GABARAPO95166 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms