Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAGEC1O60732 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAGEC1O60732 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms