Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF103O00237 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF103O00237 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF103O00237 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF103O00237 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF103O00237 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF103O00237 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF103O00237 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF103O00237 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF103O00237 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF103O00237 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF103O00237 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF103O00237 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF103O00237 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF103O00237 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF103O00237 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF103O00237 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms