Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROB1E7EW31 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms