Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL13AP40429 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL13AP40429 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL13AP40429 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL13AP40429 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL13AP40429 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL13AP40429 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL13AP40429 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL13AP40429 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL13AP40429 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL13AP40429 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL13AP40429 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPL13AP40429 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RPL13AP40429 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL13AP40429 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms