Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXD11P31277 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXD11P31277 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXD11P31277 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD11P31277 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD11P31277 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD11P31277 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD11P31277 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXD11P31277 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXD11P31277 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXD11P31277 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXD11P31277 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXD11P31277 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD11P31277 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXD11P31277 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXD11P31277 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HOXD11P31277 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXD11P31277 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXD11P31277 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXD11P31277 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXD11P31277 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXD11P31277 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXD11P31277 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXD11P31277 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXD11P31277 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXD11P31277 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXD11P31277 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXD11P31277 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXD11P31277 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXD11P31277 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXD11P31277 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXD11P31277 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXD11P31277 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXD11P31277 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXD11P31277 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXD11P31277 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms