Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB4P17483 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB4P17483 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXB4P17483 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXB4P17483 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB4P17483 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB4P17483 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB4P17483 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB4P17483 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB4P17483 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB4P17483 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB4P17483 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB4P17483 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB4P17483 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB4P17483 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB4P17483 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB4P17483 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB4P17483 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB4P17483 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB4P17483 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB4P17483 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB4P17483 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB4P17483 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXB4P17483 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXB4P17483 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXB4P17483 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms