Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LEMD3Q9Y2U8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms