Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y258

CCL26, C-C motif chemokine 26, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL26Q9Y258 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL26Q9Y258 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL26Q9Y258 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCL26Q9Y258 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms