Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APPL1Q9UKG1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms