Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5BQ9UGL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
KDM5BQ9UGL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM5BQ9UGL1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms