Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX3Q9UBR4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX3Q9UBR4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX3Q9UBR4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms