Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE7Q9UBL6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPNE7Q9UBL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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