Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
COA4Q9NYJ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COA4Q9NYJ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COA4Q9NYJ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms