Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIX2Q9NPC8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIX2Q9NPC8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX2Q9NPC8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms