Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP85Q9BW27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP85Q9BW27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms