Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABRG3Q99928 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms