Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC13Q8IYE1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC13Q8IYE1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms