Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM139Q8IV31 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM139Q8IV31 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms