Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC39A4Q6P5W5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC39A4Q6P5W5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC39A4Q6P5W5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms