Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF38BQ5VTL8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38BQ5VTL8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38BQ5VTL8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms