Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC45A4Q5BKX6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC45A4Q5BKX6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms