Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FXNQ16595 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FXNQ16595 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FXNQ16595 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FXNQ16595 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FXNQ16595 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FXNQ16595 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FXNQ16595 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FXNQ16595 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FXNQ16595 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FXNQ16595 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FXNQ16595 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FXNQ16595 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FXNQ16595 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FXNQ16595 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FXNQ16595 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FXNQ16595 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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FXNQ16595 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FXNQ16595 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FXNQ16595 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FXNQ16595 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FXNQ16595 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FXNQ16595 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FXNQ16595 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FXNQ16595 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
FXNQ16595 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
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