Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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