Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB35Q15286 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB35Q15286 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms