Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF9Q13886 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF9Q13886 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms