Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM115Q12893 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM115Q12893 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms