Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GRIN2AQ12879 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GRIN2AQ12879 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GRIN2AQ12879 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
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