Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 DCI1YOR180C 816 nt4.76□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 CMR3YPR013C 954 nt4.76□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 ATH1YPR026W 3636 nt4.76□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 TRE1YPL176C 2352 nt4.76□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 IMA1YGR287C 1770 nt4.76□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 FUM1YPL262W 1467 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 AIR2YDL175C 1035 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 AAD4YDL243C 990 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 DAS2YDR020C 699 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 GRX4YER174C 735 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 PUS6YGR169C 1215 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 SFH5YJL145W 885 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 SFK1YKL051W 1062 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 OMA1YKR087C 1038 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 LDB18YLL049W 540 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 ELO3YLR372W 1038 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YLR462WYLR462W 609 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 TOM5YPR133W-A 153 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 MSH1YHR120W 2880 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 PAL1YDR348C 1500 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 FZO1YBR179C 2568 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 POL12YBL035C 2118 nt4.75□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 SEC9YGR009C 1956 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 PMT4YJR143C 2289 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 MCH4YOL119C 1506 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 THI5YFL058W 1023 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 BGL2YGR282C 942 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YMR315WYMR315W 1050 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 THI12YNL332W 1023 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 SSO1YPL232W 873 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 FBP26YJL155C 1359 nt4.74□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YHR182WYHR182W 2358 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 PRD1YCL057W 2139 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 TYW1YPL207W 2433 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 SCM3YDL139C 672 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 MHF2YDL160C-A 243 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 DCD1YHR144C 939 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 CKB2YOR039W 777 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YSA1YBR111C 696 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 STR2YJR130C 1920 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 BLM10YFL007W 6432 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 PXA1YPL147W 2613 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YMR1YJR110W 2067 nt4.73□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 ADE6YGR061C 4077 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 TRX2YGR209C 315 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 MET31YPL038W 534 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 ROT2YBR229C 2865 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 LEU1YGL009C 2340 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 NPL4YBR170C 1743 nt4.72□□□□□ -1.65
NMD4Q12129 SED4YCR067C 3198 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 PTC1YDL006W 846 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SLC1YDL052C 912 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TRS23YDR246W 660 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 RRP45YDR280W 918 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 FAU1YER183C 636 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SKG1YKR100C 1068 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YMR245WYMR245W 621 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YNR061CYNR061C 660 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 ZPS1YOL154W 750 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 UBA2YDR390C 1911 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 GAS4YOL132W 1416 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 FAP1YNL023C 2898 nt4.71□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 PSE1YMR308C 3270 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TUB2YFL037W 1374 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 MPC1YGL080W 393 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 MRP13YGR084C 1020 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TTI2YJR136C 1266 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YLR049CYLR049C 1287 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TRM10YOL093W 882 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 STE7YDL159W 1548 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 NGL3YML118W 1518 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 UBX7YBR273C 1311 nt4.7□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 STB2YMR053C 2553 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 RSC6YCR052W 1452 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 UGA2YBR006W 1494 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 DNF2YDR093W 4839 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 ALG2YGL065C 1512 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SUR2YDR297W 1050 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YGL193CYGL193C 312 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 QCR2YPR191W 1107 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 BUD22YMR014W 1560 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SKM1YOL113W 1968 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 SUL2YLR092W 2682 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 YTA6YPL074W 2265 nt4.69□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TYR1YBR166C 1359 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 TDA11YHR159W 1515 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 NOC4YPR144C 1659 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 NUP42YDR192C 1293 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 RPL28YGL103W 450 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 CAX4YGR036C 720 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 MRPL6YHR147C 645 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 CYC1YJR048W 330 nt4.68□□□□□ -1.66
NMD4Q12129 HRT3YLR097C 1035 nt4.68□□□□□ -1.66
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