Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RUNX1Q01196 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms