Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHOAP61586 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHOAP61586 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHOAP61586 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOAP61586 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOAP61586 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOAP61586 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOAP61586 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOAP61586 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOAP61586 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOAP61586 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOAP61586 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms