Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGGT1BP53609 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP53609 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP53609 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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