Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC11A2P49281 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC11A2P49281 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms