Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA3P42263 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA3P42263 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms