Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF4A3P38919 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF4A3P38919 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF4A3P38919 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms