Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN7P35236 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN7P35236 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms